民航运输学院2022年9月成功获批为上海市高水平高职专业群,2023-2025年专业群将依托民航，立足长三角区域一体化航空产业布局和上海国际航空枢纽港的区域经济发展，围绕现代民航运输服务产业链，以民航运输服务专业为核心，以航空物流管理、民航电子商务等专业为重点，促进专业资源整合和结构优化。专业群建设从加深专业的“深度”和拓宽服务的“维度”两个方面进行推进，通过创新人才培养模式、优化课程体系和资源建设、强化师资队伍、升级实训条件和深化国际合作，到2025年将民航运输服务专业群建成人才培养质量高、行校企融合深入、社会服务能力强的国内引领示范、国际有一定影响力的高水平专业群。

为了进一步深化专业建设、完善“1+X”证书制度试点工作、强化校企、配套浦东知行楼改扩建项目及整合龙华校区现有的民航运输各类软硬件设施设备，民航运输学院完成了2023-2025年度民航局教育人才类运输实验室建设项目申报工作，7月完成民航局评委会的线上答辩。目前，该项目已正式获批。民航运输实验室建设项目主要包括货运与客运区两大功能模块。